Do doby úplného odstránenia nedostatkov je certifikácia pozastavená a certifikát nie je subjektu vydaný. V prípade neodstrániteľnosti, alebo nezlúčiteľnosti s certifikačnými pravidlami sa certifikácia ukončí bez vydania certifikátu. Taktiež subjekt nie je pred skončením certifikácie a samotným úspešným zavŕšením certifikácie a následne vydaním certifikátu oprávnený používať, spomínať v textoch, alebo akokoľvek inak používať názov bezpečný eshop Certifikačnej autority internetového obchodu. Komunikácia s Certifikačnou autoritou internetového obchodu () prebieha výlučne elektronickou formou, kde je možné plne chronologicky sledovať a dohľadať postup certifikácie. Počas platnosti certifikátu bezpečný eshop Certifikačnej autority internetového obchodu v prípade zistenia nedostatkov je obchodník upozornený na odstránenie nedostatkov v stanovenej lehote. Pri neodstránení nedostatkov obchodník stráca certifikát bezpečný eshop bez náhrady certifikačného poplatku. V prípade neodstrániteľnosti, alebo nezlúčiteľnosti nedostatkov s certifikačnými pravidlami je certifikát bezpečný eshop odobratý.